双侧基底节区腔隙性脑梗塞一般不严重，预后较好。
此疾病属于脑深部微小梗死灶，其直径小于15毫米，不会造成严重的神经功能障碍，因此预后相对良好。该病通常是由长期存在的高血压、高血脂等基础疾病所诱发，容易复发，需要定期复查以及生活方式干预来预防病情进展。
双侧基底节区腔隙性脑
梗塞还可能伴有糖尿病或颈动脉狭窄等危险因素时，由于血管病变导致血流动力学改变，易发生缺血缺氧而形成微栓子，进一步加重脑组织损伤，增加治疗难度与风险。
针对双侧基底节区腔隙性脑梗塞，应积极控制血压、血糖水平，并在医生指导下服用抗凝药物以减少再次发作的风险。患者平时还要注意休息，避免过度劳累，以免影响恢复。
