巨乳头结膜炎的治疗可能需要采取中药外敷、抗病毒眼药水、抗炎药物治疗、激光治疗、冷冻治疗等措施。由于巨乳头结膜炎的复杂性，建议在专业医生指导下进行治疗。

1.中药外敷

通过在眼部皮肤上贴敷具有清热解毒功效的中药材，如黄连、黄柏等，缓解炎症。具体使用剂量需遵医嘱。适用于轻度巨乳头结膜炎患者，可作为辅助治疗手段。

2.抗病毒眼药水

抗病毒眼药水可以针对特定的病毒成分进行抑制和清除，从而减少对结膜组织的损害。对于由疱疹病毒感染引起的巨乳头性结膜炎有较好的效果。

3.抗炎药物治疗

抗炎药物能够减轻巨乳头结膜炎导致的眼部红肿、疼痛等症状。适合因免疫反应过度而引发的巨乳头性结膜炎患者。

4.激光治疗

激光治疗通过高能量光束精确地破坏异常增生的组织，达到去除病变的目的。主要针对顽固性或复发性巨乳头结膜炎病例，在专业医师指导下进行。

5.冷冻治疗

利用低温使病变组织坏死脱落，以达到消除结膜下乳头状增殖的方法。对于体积较大或位置特殊的乳头状增殖可行此法。

巨乳头结膜炎是一种较为复杂的眼科疾病，建议患者及时就医并在医生的指导下接受规范化治疗，以免延误病情。