肛门指检通常不会损伤直肠黏膜，但需要由受过专业训练的医务人员进行。

肛门指检是一种常见的临床检查方法，通过医生的手指进入肛门进行触诊，以了解肛门及直肠的情况。在正常情况下，该过程是无创的，不会导致直肠黏膜损伤。但在某些情况下，如存在严重的肛裂、痔核脱出等情况时，由于手指刺激或压迫，可能会引起不适甚至轻微出血，但并不属于损伤范畴。因此，在大多数情况下，肛门指检是安全且不会造成损伤的。

如果患者有凝血功能障碍或者局部有炎症反应，则可能导致出血量增加。

在进行肛门指检前，应告知医生是否存在任何疼痛或不适感，并确保排空膀胱以防误判。如有特殊情况，应提前告知医生以便采取相应措施。