慢性结肠炎是一种慢性、长期反复发作的疾病，治疗比较困难，疗程比较长。但是可以通过抗感染治疗、免疫抑制治疗、止泻治疗、解痉止痛治疗等方法进行治疗，通常可以达到临床治愈。
1、抗感染治疗：如果患者有感染的情况，如细菌感染等，可以使用氨苄西林、美罗培南等抗生素进行抗感染治疗，需遵医嘱按疗程用药;
2、免疫抑制治疗：如果其他治疗措施效果不佳，可以使用硫唑嘌呤、甲氨蝶呤等免疫抑制剂进行治疗，可以改善肠道的炎症反应，减少炎症因子的产生，从而缓解慢性结肠炎的症状;
3、止泻治疗：慢性结肠炎的患者通常会有腹泻的症状，可以使用蒙脱石散、药用炭、洛哌丁胺等药物进行止泻，可以减少肠蠕动，保护肠黏膜，改善腹泻的症状;
4、解痉止痛治疗：如果慢性结肠炎导致肠道痉挛，患者会出现腹痛的症状，可以使用阿托品、山莨菪碱等解痉止痛的药物进行治疗。如果慢性结肠炎导致肠道炎症，出现腹泻导致的肠道痉挛，可以使用颠茄片等药物进行解痉止痛治疗;
5、手术治疗：如果慢性结肠炎发生了癌变，在严重影响生活质量的情况下，可以进行手术治疗，如切除溃疡性结肠炎的病变部位等。
除上述治疗方法外，还可以通过饮食调理、心理治疗等方法进行治疗。饮食上避免吃辛辣、刺激性的食物，如辣椒、芥末等，要吃一些清淡、好消化的食物，如米粥、面条等，同时要放松心情、保持良好的心态，对于疾病的恢复有帮助。
