早上起来咽口水上颚干痛可能是环境因素、饮食习惯、长期张口呼吸等原因引起的。

环境因素：如空气干燥，可使唾液蒸发速度加快，从而出现上述现象。饮食习惯：睡前摄入辛辣刺激性食物会刺激上颚黏膜，引起局部炎症反应，进而引发上述症状。长期张口呼吸会导致呼吸道水分蒸发过快，从而引起上颚黏膜干燥。

建议适当增加室内湿度，并保持良好的生活习惯，以减少对上颚黏膜的刺激。

如果患者存在慢性扁桃体炎或慢性咽炎等疾病时，炎症因子可能会导致黏膜充血水肿，当夜间睡眠时，由于体位改变，咽喉部积聚的分泌物增多，容易形成痰液附着在咽后壁上，从而引起咽干、疼痛等症状。

针对早晨起床后咽口水感到上颚干痛的症状，在排除生理性原因后，应及时就医检查，以便明确诊断并接受相应治疗。同时，注意保持口腔卫生，避免食用过于刺激性的食物，有助于缓解症状。