巨输尿管可能引起肾萎缩。

巨输尿管导致输尿管堵塞，尿液引流不畅，引起肾盂扩张和肾积水，长期肾积水会使肾组织受到压迫和损伤，肾皮质变薄，肾髓质出现瘢痕形成，最终导致肾萎缩的发生。

肾萎缩意味着肾脏体积缩小，但并不代表肾功能完全丧失，仍需及时治疗以防止病情进展。

如果患者存在双侧巨输尿管，则可能会因为单侧肾功能受损而影响另一侧肾脏的工作负荷，从而加速其萎缩进程。

对于巨输尿管引起的肾萎缩，应避免进一步加重肾脏负担，减少蛋白质摄入，控制血压在正常范围，并定期监测肾功能指标。