脚趾甲长出两层可能是真菌感染、外伤导致甲床损伤、遗传因素、维生素缺乏、糖尿病等病因导致的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，以便获得适当的诊断和治疗。

1.真菌感染

当指甲被真菌侵袭时，会导致角质层增厚，进而出现分层的情况。患者可在医生指导下使用抗真菌药膏进行局部涂抹，如特比萘芬乳膏、酮康唑软膏等。

2.外伤导致甲床损伤

由于受到外界撞击或者挤压等原因引起甲床部位受损，在愈合过程中可能会形成多个指甲板，从而表现为脚趾甲长出两层的现象。

轻微的甲床损伤可通过定期修剪和保持局部清洁来促进愈合。对于严重者，则需要到医院由专业医师进行处理。

3.遗传因素

遗传因素可能导致个体易感于某些类型的足部健康问题，包括足癣和灰指甲，这些都可能影响趾甲生长模式。针对遗传性足部真菌感染，可遵医嘱口服伊曲康唑胶囊、盐酸特比萘芬片等药物进行治疗。

4.维生素缺乏

若体内存在维生素A、B族维生素以及钙元素等物质的缺乏现象发生后，会影响到机体组织正常运行所必需的营养物质含量处于偏低水平状态，致使以上多种不同作用的物质无法发挥其应有的效果，继而导致指甲出现变脆、脱落等情况发生。补充维生素可以改善指甲脆弱的症状，日常生活中可以通过进食胡萝卜、鸡蛋、牛奶等食物获取所需维生素。

5.糖尿病

高血糖状态下，皮肤微血管病变，下肢血液循环受阻，容易诱发足癣的发生，进一步加重足癣的程度，导致脚趾甲出现异常改变。控制好血糖是关键所在，患者应严格遵循医嘱服用格列齐特缓释片、格列吡嗪控释片等降糖类药物进行调理。

建议定期观察脚趾甲的变化情况，必要时进行真菌培养以确定是否存在真菌感染。同时注意个人卫生，避免共用拖鞋、毛巾等生活用品，穿着透气舒适的鞋子，以减少真菌繁殖的机会。