上海治疗肛瘘最专业的医院可以考虑复旦大学附属华山医院、上海交通大学医学院附属瑞金医院、上海市靠前人民医院、上海中医药大学附属龙华医院、上海长海医院等，这些医院都在上海肛肠医院十佳排行榜单中。
1.复旦大学附属华山医院
复旦大学附属华山医院是综合性的三级甲等医院，在肛瘘治疗方面具有丰富的经验。该院擅长复杂性肛瘘、高位肛瘘等疑难病例的诊治，得益于先进的设备及技术优势。
2.上海交通大学医学院附属瑞金医院
上海交通大学医学院附属瑞金医院是一家集医疗、教学与科研为一体的大型综合性三级甲等医院，其肛肠科在国内享有较高声誉。该医院专注于直肠脱垂、痔、肛裂等常见病以及结核性肛痿、特异性肛痿等少见或罕见疾病的研究与诊疗工作。良好的学术氛围促进了临床技能的提升。
3.上海市靠前人民医院
上海市靠前人民医院是一所历史悠久且规模庞大的三级甲等公立医院，设有独立的肛肠外科，为患者提供全方位的肛瘘诊疗服务。医院致力于开展各种类型的肛瘘手术，包括传统切开挂线术、经括约肌间隙入路微创术等，并注重术后管理以促进愈合。此外还开展了生物反馈疗法、盆底功能训练等非手术治疗方法来缓解症状。
4.上海中医药大学附属龙华医院
上海中医药大学附属龙华医院是集医疗、教学、科研于一体的中医综合性医院，拥有较为完备的肛肠科服务体系。该医院在中西医结合治疗肛瘘方面积累了丰富经验，能够针对不同病因和病情特点制定个性化方案，并辅以中药外敷、针灸等手段以达到比较好效果。
5.上海长海医院
上海长海医院是一所集医疗、教学、科研于一体的综合性三甲医院，其肛肠外科是国内较早开展肛瘘手术的单位之一。该科室在肛瘘诊断与治疗方面不断创新，如应用内镜下微创技术进行诊断和治疗，这使得手术创伤小、恢复快成为可能；同时他们还积极开展新技术新方法培训，提高整体技术水平。
肛瘘是一种常见的肛门疾病，建议定期进行肛周检查，早期发现病变并及时处理。日常生活中应保持良好的排便习惯，避免便秘或腹泻，减少对肛门区域的刺激。