上海市肛肠科医院的佳排名榜单中，复旦大学附属华山医院、上海交通大学医学院附属新华医院、上海中医药大学附属曙光医院、上海长海医院、上海长征医院都是治疗肛肠科疾病的优秀选择。

1.复旦大学附属华山医院

复旦大学附属华山医院是上海市的一所三级甲等综合性医院，在肛肠科方面具有较高的医疗水平。该院的肛肠科在学术研究、临床实践等方面处于国内领先地位，能够为患者提供高质量的诊疗服务。

2.上海交通大学医学院附属新华医院

上海交通大学医学院附属新华医院是一所集医疗、教学、科研于一体的大型综合医院，在肛肠科领域有着较高的声誉。该医院的肛肠科拥有一支经验丰富的专家团队，他们熟练掌握各种肛肠疾病的诊断与治疗方法，能够为患者提供全面的医疗服务。

3.上海中医药大学附属曙光医院

上海中医药大学附属曙光医院是一家集医疗、教学、科研为一体的中医医院，在传统中医学的基础上开展肛肠科疾病的研究和诊治工作。该医院的肛肠科以中医特色鲜明著称，擅长运用中药外敷、内服及针灸等方法治疗各类肛肠疾病，深受广大患者的信赖。

4.上海长海医院

上海长海医院是卫生健康委员会指定的全国疑难重症诊治指导中心之一，其肛肠科在国内享有较高声誉。该科室致力于开展复杂性肛门直肠疾病的微创手术治疗，如结直肠癌治疗术、肛瘘挂线术等，技术精湛且并发症少。

5.上海长征医院

上海长征医院是卫健委直属的三级甲等综合性医院，其肛肠科在华东地区乃至全国范围内都颇具影响力。该科室拥有先进的设备和优秀的医护团队，可针对多种常见及罕见的肛周疾患进行精准诊断和有效干预。

建议患者在选择治疗肛肠病的医院时，应考虑个人经济承受能力以及医保政策覆盖范围，确保就医过程中的经济负担可控。