跑步时肚子痒可能是由于脂肪燃烧、皮肤微循环加快以及新陈代谢加速所致。

脂肪燃烧会导致体内产生更多的热量，使皮肤血管扩张，血液循环加快，进而引发瘙痒感。同时，随着脂肪的代谢，身体中的废物也会随之排出，这些废物可能对皮肤产生一定的刺激作用，导致瘙痒。另外，长时间缺乏锻炼的人在开始跑步时，身体会产生一种叫做组胺的物质，这种物质会引起局部炎症反应，从而导致瘙痒。

如果患者患有湿疹、荨麻疹等疾病，则可能会因为运动时出汗而诱发或加重病情，出现上述不适症状。

因此，在跑步过程中，特别是对于初次跑步或长期缺乏运动者，应注意适度增加运动强度和时间，以减少不适的发生。此外，穿着透气性好的衣物也有助于减轻皮肤的不适感。