肛门尖锐湿疣破了痛是因为皮肤表面受到损伤，引起神经末梢刺激，从而产生疼痛感。

肛门尖锐湿疣是一种由人乳头瘤病毒感染引起的疾病，其主要症状是肛门周围出现小的、柔软的突起物，这些突起物容易破裂出血，导致疼痛。此外，由于肛门部位的皮肤较为脆弱，易受摩擦和感染等因素的影响，因此一旦发生病变，就会引发明显的不适感。

如果患者在患病期间存在局部瘙痒的症状，在搔抓后可能会导致皮损加重，进而诱发疼痛的现象。

患者应避免过度清洗或用力擦拭患处，以免进一步刺激受损的皮肤。同时注意个人卫生，保持肛周干燥清洁，以促进伤口愈合。