怀孕48天胚胎停止发育可能是染色体异常引起的。

染色体异常是指细胞内染色体数目、结构发生变化，包括缺失、重复、易位、倒位等，此时可能会出现流产、死胎、畸形儿等情况。如果染色体异常是由于基因突变造成的，则通常无法预防，因为基因突变具有随机性和不可预测性；而如果是由于环境因素，如放射线照射、化学物质暴露等引起的，则可通过避免接触相关有害物质来降低风险。

除了染色体异常外，黄体功能不足、甲状腺功能减退症以及子宫肌瘤等因素也可能导致怀孕48天胚胎停止发育。这些疾病会影响胎儿的生长发育，进而引起胚胎停育的现象发生。

建议患者定期进行孕期检查，尤其是对于有不良孕产史或家族遗传病史者，应加强监测以早期发现并处理可能导致胚胎停育的风险因素。此外，孕妇在日常生活中还应注意保持良好的生活习惯，保证充足的睡眠时间，并适当进行一些轻度运动，如散步，有助于提高身体素质，也有助于减少胚胎停育的发生概率。