肺孢子虫感染的患者可采取阿奇霉素、克林霉素、甲硝唑、环丙沙星、利福平等药物进行治疗。这些药物需遵医嘱使用，患者不可私自用药。

1.阿奇霉素

阿奇霉素通过抑制细菌蛋白质合成来杀死细菌，从而达到治疗肺孢子虫的目的。适用于耐药性较低的患者。

2.克林霉素

克林霉素能有效干扰细菌细胞壁的合成过程，阻断其生长繁殖，对肺孢子虫有较好的杀灭效果。对青霉素过敏者可选用此药。需监测肝功能。

3.甲硝唑

甲硝唑具有抗厌氧菌及原虫的作用，能够有效地破坏寄生虫的DNA结构，使其失去活性。主要用于寄生虫感染引起的疾病。使用时应注意观察中枢神经系统副作用。

4.环丙沙星

环丙沙星属于喹诺酮类抗生素，可以阻碍细菌DNA回旋酶的活性，阻止DNA复制和转录，进而干扰细菌的生长、繁殖。本品可用于敏感菌株所致的轻度至中度感染。不宜长期大量使用。

5.利福平

利福平为广谱杀菌剂，主要通过抑制细菌依赖于DNA的RNA多聚酶的活性，阻碍细菌RNA的合成，从而影响细菌的核酸代谢。本品主要用于结核病及其他分枝杆菌感染。在服用期间应定期检查血象、尿常规等。

针对肺孢子虫感染，除上述药物外，患者还可遵医嘱使用泼尼松、地塞米松等糖皮质激素类药物辅助治疗。患者平时还要注意休息，保证充足的睡眠时间，有利于疾病的恢复。