上海康复医院前五名的机构包括复旦大学附属华山医院、上海交通大学医学院附属瑞金医院、上海中医药大学附属曙光医院、上海长海医院以及上海长征医院。

1.复旦大学附属华山医院

复旦大学附属华山医院是上海市的一所三级甲等综合性医院，在神经内外科、骨外科等领域具有较高声誉。该医院拥有先进的医疗设备及技术力量雄厚的医护团队，能够为患者提供高质量的康复医疗服务。

2.上海交通大学医学院附属瑞金医院

上海交通大学医学院附属瑞金医院是一家集医疗、教学与科研为一体的大型综合医院，其康复医学科在国内享有盛誉。该医院拥有一支由国内外知名专家组成的高水平医疗队伍，并且不断引进先进技术和理念以满足患者需求。

3.上海中医药大学附属曙光医院

上海中医药大学附属曙光医院是一所集医疗、教学、科研于一体的综合性中西医结合医院，设有康复医学科。该科室秉承传统中医特色疗法与现代康复技术相结合的理念，致力于为广大民众提供优质、安全、有效的康复服务。

4.上海长海医院

上海长海医院是卫生健康委员会指定的全国疑难重症诊治中心之一，其康复医学科在运动损伤康复方面颇具实力。该科室采用个性化评估与治疗方案制定相结合的方法来帮助患者恢复功能，并且注重培养医患之间良好的沟通关系。

5.上海长征医院

上海长征医院是卫生健康委员会批准设置的三级甲等综合性医院，其康复医学科在脊髓损伤后遗症管理方面有独到之处。该科室通过多学科协作模式为患者提供全方位的康复服务，并且积极开展新技术研究以提高临床效果。

选择合适的康复医院应考虑其专业性以及是否具备针对特定疾病的专项康复设施。