肛瘘手术后肛门内出现疙瘩可能是术后并发症，如切口愈合不良、皮脂腺囊肿等。

肛瘘手术时会切断异常管道及周围坏死组织，但有时难以彻底清除病变组织，可能导致切口愈合不良而形成硬结。皮脂腺囊肿是皮肤中皮脂腺导管堵塞，导致分泌物潴留形成的囊性肿块，在肛门处也较为常见。对于术后的疙瘩，应首先明确其性质，以便及时处理。

此外，还可能与痔疮复发、感染引起脓肿或新发疾病等情况有关。这些情况都需密切观察，必要时应及时就医。

术后患者应注意保持肛周清洁干燥，避免局部过度摩擦和用力排便，以减少不适症状的发生和促进伤口愈合。同时，若发现肛门内存在异常增生物或其他不适症状，应及时复诊评估病情变化。