巧克力囊肿的治疗可以考虑腹腔镜手术、孕三烯酮、醋酸亮丙瑞林、非那雄胺、中药调理等方法。如果囊肿增大或症状加重，建议及时就医，以便选择最适合的治疗方案。

1.腹腔镜手术

腹腔镜手术通过小切口进入盆腔，在直视下清除子宫内膜异位病灶，包括卵巢上的巧克力囊肿。此方法适合直径大于3厘米且引起疼痛、不孕等症状的巧克力囊肿。

2.孕三烯酮

孕三烯酮是一种激素类药物，能够抑制雌激素的作用，从而减少巧克力囊肿的发生和发展。对于预防新发囊肿或缩小现有囊肿有一定效果，适用于轻度至中度的巧克力囊肿患者。

3.醋酸亮丙瑞林

醋酸亮丙瑞林是一种促性腺激素释放激素激动剂，能暂时停顿生殖系统功能，降低雌激素水平，间接影响巧克力囊肿的发展。主要用于需要快速缓解症状或准备怀孕的患者。使用时需注意可能出现潮热、阴道干燥等绝经前症状。

4.非那雄胺

非那雄胺主要通过竞争性抑制5α-还原酶来阻断睾酮向二氢睾酮的转化，降低血清及组织中的二氢睾酮浓度，进而减轻其对囊肿的影响。适用于有高雄激素表现的巧克力囊肿患者，可减缓囊肿增长速度。

5.中药调理

中药调理是利用具有活血化瘀、消症散结功效的中药材如桃仁、红花、丹参等，以汤剂或丸散形式服用，调节体内气血平衡，辅助消除巧克力囊肿。适用于较小且症状不明显者，旨在改善症状、控制病情发展。

针对巧克力囊肿的治疗应综合考虑囊肿大小及症状严重程度。建议定期复查，以便及时发现病情变化，并在医生指导下选择合适的治疗方案。