肾穿刺术通常会有轻微至中度的疼痛，但一般可以忍受。
肾穿刺术是在局部麻醉下进行的，取样过程中会感到轻微至中度的疼痛，因为肾位于后腰部，此处神经末梢较为丰富，所以疼痛感比较明显。但是由于每个人的痛阈值不同，部分敏感体质的人可能感觉更强烈一些。为减少疼痛，可在术前告知医生个人情况，以便调整麻醉方式或加强止痛措施。
肾穿刺术后可能会出现血尿、腰痛等不适症状，如果这些症状持续时间较长或者程度较重，则需要及时就医处理。
在进行肾穿刺时应避免过度紧张，配合医生指示完成操作，并注意观察术后身体反应，以减少不必要的风险。
