三个月自然流产可以通过保宫止血颗粒、米索前列醇、垂体后叶素、缩宫素、刮宫术等治疗措施进行处理。由于自然流产可能引起严重的并发症，建议在专业医生指导下进行治疗。

1.保宫止血颗粒

保宫止血颗粒具有收缩子宫、止血的作用，能减少流产后出血量。适用于阴道流血较多的情况。

2.米索前列醇

米索前列醇能够促进子宫平滑肌收缩，加速胚胎组织排出。

对于不完全流产情况有较好效果。

3.垂体后叶素

垂体后叶素通过刺激肾上腺皮质激素分泌，增强机体应激反应，从而达到止血的目的。主要针对大出血紧急状况下使用。

4.缩宫素

缩宫素可以模拟正常分娩时催产素的释放模式，刺激子宫平滑肌收缩，帮助将残留物排出。适合处理流产后宫腔内残留引起的轻微出血或不适。

5.刮宫术

刮宫术是通过医疗器械清除宫腔内残留物的一种手术方式，可直接解决宫腔内残留的问题。当存在较大面积的胎盘组织残留或其他原因导致上述药物治疗无效时，可考虑刮宫术。

在诊断为自然流产后，应避免剧烈运动，以免加重身体负担。同时保持外阴清洁干燥，避免感染风险。饮食方面宜清淡且营养均衡，如小米粥、鸡蛋羹等，有利于补充身体所需营养，利于身体恢复。