三个月咽喉里有白色的脓疱可能是慢性咽炎或扁桃体炎引起的。

慢性咽炎或扁桃体炎是由病毒、细菌或其他病原体持续感染所致，这些病原体会刺激局部的淋巴细胞和组织发生炎症反应，进而导致黏膜下的淋巴滤泡增生，形成白色脓疱。当病情迁延不愈时，会导致上述症状长时间存在。

此外，还应考虑是否存在口腔溃疡、舌乳头炎等疾病。这些疾病都可能导致口腔内出现白色的小水疱，但通常不会引起长期的不适症状。

患者在日常生活中应注意保持良好的个人卫生习惯，避免接触已知过敏原，并定期清洁口腔以减少致病菌的数量。若发现异常现象，应及时就医以便获得适当的治疗。