肚子疼小便结束时有刺痛感，可能是急性尿道炎、急性膀胱炎、输尿管结石、前列腺炎等原因导致。建议患者及时到医院就诊，查明病因后，可在医生指导下进行针对性治疗。

1、急性尿道炎：不良卫生习惯等因素可引起急性尿道炎，导致尿道黏膜充血水肿，排尿时尿液对尿道造成刺激，从而引起肚子疼小便结束时有刺痛感的情况，还可伴有尿频、尿急等症状，可遵医嘱应用阿莫西林、左氧氟沙星等抗生素药物进行治疗;

2、急性膀胱炎：多由于膀胱内残留细菌，导致膀胱局部出现炎症，排尿时尿液对膀胱造成刺激，从而出现肚子疼小便结束时有刺痛感的情况，还可伴有尿频、尿急等症状。确诊后应遵医嘱使用敏感抗生素类药物治疗，如阿奇霉素、阿莫西林等，必要时还可配合应用缓解膀胱痉挛的药物改善症状，如酒石酸托特罗定片等;

3、输尿管结石：存在输尿管结石时，结石位于输尿管下段或者膀胱内，在排尿时尿液会对输尿管造成刺激，引起肚子疼小便结束时有刺痛感的情况，还会伴有血尿、腰部疼痛等症状。当输尿管结石直径较大无法排出时，应考虑进行体外冲击波碎石或输尿管腔镜碎石术等手术治疗;

4、前列腺炎：多与不洁性生活、频繁手淫等因素有关，导致前列腺局部充血肿大，小便时会对肿大的前列腺造成刺激，从而引起肚子疼小便结束时有刺痛感的情况。确诊后可遵医嘱使用前列舒通胶囊、左氧氟沙星等药物进行治疗，可改善症状。