慢性鼻窦炎通常是由细菌感染引起的，主要症状是反复发作的上呼吸道感染，如头痛、面部压痛等，一般不会导致基因突变。而鼻咽癌主要是由环境因素、遗传因素及饮食因素共同作用的结果，其发生与EB病毒感染密切相关。虽然两者之间没有直接联系，但由于慢性鼻窦炎患者的免疫系统处于一种应激状态，此时如果受到其他致癌因素的影响，可能会增加患鼻咽癌的风险。
在极少数情况下，长期未经治疗的慢性鼻窦炎可能伴随炎症因子持续刺激，存在一定的癌变风险。
针对慢性鼻窦炎的治疗需及时、规范，以减少并发症的发生概率，降低癌变风险。患者平时还要注意保持良好的生活习惯，避免吸烟、喝酒，也要适当锻炼身体，提高机体免疫力。
