小孩脑炎后不自主抖动可能是由于神经元损伤引起的异常放电所致。

脑炎是由各种病原体如病毒、细菌、真菌等侵袭中枢神经系统所引起的急性炎症性疾病。在疾病的发展过程中，由于炎症因子的作用，会导致神经元受损，使神经递质传递异常，进而引发不自主抖动的症状。

此外，如果小孩患有癫痫或帕金森病，也可能出现不自主抖动的现象。

这些疾病的病因各异，但都可能导致神经系统的异常活动，引起肢体抽搐或震颤。

对于脑炎导致的小孩不自主抖动，家长应注意观察症状变化，并及时就医以评估是否需要抗癫痫药物治疗。而针对不同原因引起的不自主抖动，应采取相应的管理策略，如物理治疗或特定的运动训练。