复阳后小便尿道刺痛可能是由于病情复发引起的。

复阳指的是新型冠状病毒核酸检测或抗原检测由阴性转为阳性，表明机体重新感染了新型冠状病毒。该疾病会导致免疫系统的反应加剧，从而引发一系列临床表现，包括尿道刺痛。这种疼痛是由于病毒对尿道黏膜的直接侵犯以及炎症因子的刺激所导致的。

此外，如果患者存在泌尿系统结石、膀胱炎等非病毒感染性疾病时，也可能会出现复阳后小便尿道刺痛的症状。这些疾病都可能导致尿路受到刺激或损伤，引起排尿时的不适感。

面对复阳后的症状，应避免盲目使用抗生素以防止耐药性的产生。同时，在治疗期间要保持充足的水分摄入，促进病毒排出，并注意个人卫生，以免交叉感染。