甲状旁腺保留两个但仍然缺钙可能是由于甲状旁腺功能减退、维生素D缺乏、纤维囊性骨炎、肾小管酸中毒、甲状腺功能亢进症等病因导致的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，明确诊断。

1.甲状旁腺功能减退

甲状旁腺激素是由甲状旁腺分泌的一种调节钙磷代谢和血钙水平的激素。当甲状旁腺功能减退时，甲状旁腺激素分泌不足，导致破骨细胞活性降低，钙从骨骼中释放减少，肠道钙吸收受抑，进而引起低钙血症。

补充外源性甲状旁腺激素可以纠正钙代谢异常，如甲状旁腺激素替代疗法中的阿尔法-降钙素等药物。

2.维生素D缺乏

维生素D是促进肠道钙吸收和骨骼健康的重要营养物质，缺乏会导致钙吸收障碍，从而影响血液中的钙浓度。通过日晒、饮食调整或维生素D补充剂来提高体内维生素D含量，如口服维生素D滴剂或注射维生素D制剂。

3.纤维囊性骨炎

纤维囊性骨炎是一种慢性炎症性疾病，主要累及骨骼，导致新骨形成和旧骨破坏不平衡，进而影响钙盐沉积和利用。针对纤维囊性骨炎的治疗通常包括非甾体抗炎药、糖皮质激素或其他止痛药物以缓解症状，如布洛芬缓释胶囊、醋酸可的松片、对乙酰氨基酚片等。

4.肾小管酸中毒

肾小管酸中毒会影响肾脏排泄氢离子和重吸收碳酸氢根离子的功能，导致酸碱平衡失调，间接影响钙的吸收和利用。患者需要遵医嘱使用枸橼酸钾颗粒、氯化铵进行补钙治疗。

5.甲状腺功能亢进症

甲状腺功能亢进症时，甲状腺激素水平升高，促进骨质分解，抑制骨质形成，导致骨量减少，容易出现骨折。甲亢患者可在医生指导下服用甲巯咪唑片、丙硫氧嘧啶肠溶片等抗甲状腺药物进行治疗。

建议定期监测血钙水平，以便及时发现并处理缺钙问题。必要时，可能需进行甲状旁腺功能测定、维生素D水平检测以及骨密度测量等进一步的实验室检查。