新生儿双肺透过度减低可以考虑采取氧疗、支气管镜肺泡灌洗、肺表面活性物质替代疗法、抗生素治疗、体位引流等方法进行治疗。鉴于新生儿的特殊性，应严密监测病情变化，及时评估治疗效果并调整治疗方案。

1.氧疗

通过提高吸入氧气浓度来改善通气血流比例失调的情况，具体可通过使用高流量湿化器、面罩等设备给予患者高浓度湿化氧气。适用于存在呼吸困难导致低氧血症的患者。

在实施过程中需监测患者的血氧饱和度以确保安全有效。

2.支气管镜肺泡灌洗

利用支气管镜到达病变部位，对局部积液或分泌物进行抽吸或冲洗，从而达到清除呼吸道内异物的目的。此技术主要用于重症感染、慢性阻塞性肺疾病急性加重期等情况下引起的肺部积液或痰液粘稠难以排出时。

3.肺表面活性物质替代疗法

补充缺失或不足的肺表面活性蛋白，以降低肺泡表面张力，并增加其稳定性；例如采用脂质类药物如磷脂酰胆碱或多烯脂肪酸甘油酯进行治疗。对于早产儿或有呼吸窘迫综合征的新生儿而言是有效的。需要密切观察是否有过敏反应发生。

4.抗生素治疗

针对由细菌感染引起的原因，选择合适的抗生素进行治疗，如青霉素G、阿莫西林克拉维酸钾等。当考虑是由细菌感染引起时，可遵医嘱使用上述药物进行抗感染治疗。

5.体位引流

改变体位使重力帮助痰液移动至更容易咳出的位置，促进排痰。用于缓解因黏液分泌增多而引起的呼吸困难。实施前应评估患者耐受性及可能出现的风险。

新生儿双肺透过度减低可能表明存在肺部疾病或先天性异常，建议尽快就医以便进行进一步检查和确诊。同时，应避免吸烟环境，保持室内空气清新，以减少对患儿的不利影响。