附睾囊肿是男性生殖系统常见的疾病，主要是由于精液淤滞、附睾腺管堵塞等原因造成，对男性生育功能有一定影响，但通常不会影响精子的畸形率。正常精子的畸形率通常在96%以下，但畸形率过高的精子会受到很多影响，主要包括精索静脉曲张、附睾炎、精囊炎、睾丸炎等。

1、精索静脉曲张：附睾囊肿可能会压迫到精索内静脉，影响静脉回流，同时可引起静脉瓣功能不全，导致精索静脉回流障碍。当出现上述情况时，可能会引起睾丸组织缺血、缺氧，从而影响精子质量，但通常不会导致精子畸形率过高;

2、附睾炎：附睾囊肿可能是由于附睾内部出现感染后，病原菌分泌的液体进入精囊内部而引起，炎症可以破坏精子发生自闭，从而影响精子畸形率;

3、精囊炎：由于逆行感染所致，炎症可以破坏精囊内部环境，同时可引起射精管堵塞，导致精子无法正常进入输精管内，而逆行进入附睾导致精子畸形率过高;

4、睾丸炎：附睾囊肿患者也容易出现附睾炎，由于炎症刺激可能会引起附睾组织渗出增加，从而引起附睾囊肿。

患者有附睾囊肿时，可以通过B超检查明确诊断。如果囊肿体积较小，且患者并无不适症状，通常可以暂时观察，遵医嘱定期复查。如果囊肿体积较大或患者出现不适症状，可以选择手术切除，如经尿道切开囊肿切除术等。