多发肝囊肿伴有右上腹闷痛时，应考虑手术治疗。

多发肝囊肿通常需要通过手术切除来缓解症状，改善预后。该疾病一般不会自行消失，且随着囊肿增大可能会出现并发症，因此需积极处理。

如果患者还存在胆管炎、胆石症等疾病，则可能因为炎症或结石刺激而引起右上腹疼痛。此时需要针对具体病因进行针对性治疗，如使用抗生素控制感染，必要时可遵医嘱采用胆囊切除术、经皮经肝胆管穿刺引流术等方式治疗。

对于多发肝囊肿引起的右上腹闷痛，应注意避免食用易产生气体的食物，以减少腹部不适。定期复查肝脏超声和其他相关检查是必要的，以便监测囊肿的变化。