脚上长了透明的小凸起且伴有疼痛可能是跖疣的症状。

跖疣是由人乳头瘤病毒感染引起的皮肤疾病，当病毒侵入足部皮肤时，机体免疫系统会启动防御机制对抗病原体。在这一过程中，可能会产生炎症反应，导致局部红肿、疼痛等症状，同时也会刺激角质细胞过度生长，形成坚实的凸起。透明的小凸起是因为这些组织在病变区域积聚，而没有被正常的色素所填充。

为了确保病情得到准确诊断和适当治疗，建议患者及时就医咨询皮肤科医生。

此外，如果患者的症状持续超过一个月或伴有渗出液，则可能需要进一步排除汗管瘤等其他皮肤疾病的可能。

针对这种情况，患者应避免自行挤压或破坏小凸起以减少感染风险，并注意保持患处清洁干燥，穿着透气性好的鞋袜有助于减少摩擦和刺激。