胆总管囊肿术后一般不会影响肝脏。

胆总管囊肿术后，通过手术移除了导致胆汁流动受阻的病变组织，使胆汁能够正常流通。这有助于缓解胆汁淤积，减少对肝脏的损害，因此通常不会直接影响肝脏。但需注意的是，如果术后出现感染或其他并发症，可能会增加肝脏负担，此时应密切关注病情变化，并遵循医嘱进行治疗。

若患者在术后发现有不适症状或异常表现，应及时就医以评估是否与手术有关。

术后患者应注意观察自身症状变化，定期复查，保持良好的生活习惯和饮食习惯，避免过度劳累和摄入过多脂肪食物，以促进身体恢复。