先天性巨结肠扩肛术的治疗效果因人而异，通常需要数月至数年的时间才能见效。

扩肛术旨在通过扩大狭窄部位来改善肠道功能，对于先天性巨结肠引起的肠道梗阻具有一定的治疗作用。但是，由于先天性巨结肠涉及复杂的病理生理机制，如神经节细胞缺如等，因此治疗过程可能会比较漫长。此外，患者的年龄、病变范围以及是否有合并症也会影响治疗效果和时间。

鉴于上述因素的影响，治疗时间会存在较大的个体差异，因此无法给出确切的时间预估。

如果患者有严重的并发症，可能需要更频繁地进行扩肛以促进肠道功能恢复，此时费用会相应增加。

在实施扩肛术前，应进行全面评估，包括影像学检查和内镜检查，以确定病变范围和严重程度，并制定个性化治疗方案。同时，定期复查和监测病情变化也是必要的。