南通治疗性功能障碍最专业的医院可以考虑南通长城医院、南通大学附属医院、南通市靠前人民医院、南通市中医院、南通广济医院等五家男科医院，这些医院在性功能障碍的诊疗方面具有一定的优势和口碑。
1.南通长城医院
南通长城医院是患者咨询的热点之一，因其专注于男性健康。其擅长泌尿外科、男科疾病诊治，在勃起功能障碍方面有丰富的经验。
2.南通大学附属医院
南通大学附属医院也是备受关注的医疗机构，它为患者提供全面的男科医疗服务。该医院在前列腺疾病、生殖系统疾病等方面具有较高的医疗水平，因此受到好评。
3.南通市靠前人民医院
南通市靠前人民医院是一家综合性医院，设有专门的男科门诊，能够满足患者的就医需求。该医院拥有一支技术精湛的医生团队，他们在性功能障碍的诊断与治疗方面积累了丰富的经验。
4.南通市中医院
南通市中医院是一所集医疗、教学、科研于一体的大型中医医院，设有男科专科。该医院秉承传统中医药特色，采用中药内服外治相结合的方法治疗性功能障碍，深受患者信赖。
5.南通广济医院
南通广济医院是一家专业治疗男科疾病的医院，致力于为广大患者提供优质的服务。该医院拥有先进的诊疗设备和技术，能够准确诊断并有效治疗各种类型的性功能障碍。
性功能障碍涉及多种病因学因素，建议患者积极面对心理压力，保持良好的生活习惯，同时寻求专业医师的帮助以获得适当的治疗。