南通治疗胃肠科比较好的医院有南通大学附属医院、南通市靠前人民医院、南通市中医院、南通市第六人民医院、南通市妇幼保健院等，由于胃肠疾病的复杂性，建议在选择医院时要考虑其专业水平和医疗设备。

1.南通大学附属医院

南通大学附属医院是当地一所大型综合医院，提供广泛的医疗保健服务。该医院拥有一支经验丰富的胃肠科医生团队，能够为患者提供高质量的诊疗服务。

2.南通市靠前人民医院

南通市靠前人民医院是一家三级甲等综合性医院，在胃肠科方面具有较高的医疗水平。该医院引进了先进的诊疗设备和技术，能够有效地诊断和治疗各种胃肠疾病。

3.南通市中医院

南通市中医院是一所集医疗、教学、科研于一体的中医医院，设有独立的胃肠科。该科室以中医药疗法为主，擅长治疗慢性胃炎、消化性溃疡等疾病，具有独特的治疗方法。

4.南通市第六人民医院

南通市第六人民医院是一家三级乙等专科医院，其胃肠科是该院的重点科室之一。该科室拥有先进的内镜检查设备及专业的内镜操作医师，可开展各类胃肠镜检查及手术。

5.南通市妇幼保健院

南通市妇幼保健院是一所集医疗、保健、预防为一体的妇女儿童专科医院，设有独立的胃肠科。该科室专注于儿科胃肠疾病的诊治，尤其擅长婴幼儿腹泻、便秘等常见病的处理，具有丰富的临床经验。

在选择胃肠科医院时，应考虑医院的专业水平和服务质量。同时，建议定期进行胃肠健康体检，注意饮食卫生和个人卫生习惯，以减少胃肠疾病的发生风险。