孕酮低通常不会导致胎儿畸形，但可能增加流产的风险。

孕酮水平低可能导致子宫环境不利于胚胎发育，进而增加流产的风险，而胎儿畸形主要是由于染色体异常、感染等因素引起的，与孕酮水平无直接关系。

若孕期出现腹痛、阴道出血等症状，则需要及时就医治疗，以免延误病情。

因此，建议定期监测孕酮水平，保持良好的生活习惯，避免过度劳累和精神紧张，并按医嘱服用孕酮制剂以支持妊娠。