摘除卵巢囊肿后发现卵巢不见可能是手术中误切、卵巢萎缩或其他疾病引起的。

手术中误切：如果囊肿与卵巢粘连紧密，在剥离过程中容易将正常的卵巢组织一并切除，从而导致卵巢丢失。

卵巢萎缩：随着年龄的增长，卵巢逐渐萎缩退化，其体积会变小甚至消失，但并不一定需要摘除。

其他疾病：如子宫内膜异位症、多囊卵巢综合征等也可能导致卵巢缩小或被包裹，此时虽然卵巢存在，但由于受到病理性因素的影响而无法正常显示。

针对这种情况，建议患者及时到医院进行进一步检查，明确具体原因后处理。如果是手术中的误切造成的，可以考虑通过试管婴儿的方式怀孕；如果是卵巢萎缩引起的，则没有必要进行特殊治疗，顺其自然即可。

除了手术中误切外，还有可能是因为患者的卵巢功能已经衰退或者患有其他的妇科疾病，比如卵巢早衰、输卵管积水等，这些都可能导致卵巢出现异常变化，进而影响生育能力。

在摘除卵巢囊肿的过程中，应严格遵循操作规范，以减少误切风险。术后患者应注意休息，避免剧烈运动，保持阴部清洁干燥，定期复查，以便及时发现并处理任何潜在的问题。