肾结石痛起来大便困难可能是中枢神经系统对肠道运动的调节异常所致。

肾结石引起的疼痛可以刺激中枢神经系统，影响到肠道的正常蠕动功能，进而出现便秘的情况。如果症状持续不缓解或者疼痛加剧，应尽快就医以获得适当的治疗。

此外，若患者在排尿时伴随有剧烈腹痛、血尿等症状，则可能为输尿管结石导致的肾绞痛。主要是由于结石移动堵塞了输尿管，引起尿液排出受阻，此时可伴有腰腹部剧烈绞痛、恶心呕吐等症状。

对于肾结石患者，日常应注意多喝水促进排石，并定期复查以便及时发现并处理任何潜在的问题。