心包囊肿是一种先天性疾病，而心包憩室则多为后天获得性疾病。

心包囊肿属于先天性的疾病，主要是因为胚胎时期局部未退化的胚膜引起的良性肿瘤；而心包憩室多因慢性炎症导致心包增厚、纤维化，进而发生局限性薄弱或缺损所致。

心包囊肿还应与纵隔囊肿鉴别，后者包括食管旁憩室、胸腺咽囊肿等，这些病变也位于心脏周围，但通常具有不同的临床表现和影像学特征。

在诊断心包囊肿或心包憩室时，应注意区分两者及其他类似疾病的差异点，并结合影像学检查结果来确定确切诊断。患者应避免剧烈运动以减少心脏负担，定期复查以监测病情变化。