大便困难、大便变形及肛门痛可能是由多种因素引起的，包括饮食习惯不良、药物副作用、精神心理因素、器质性病变以及其他疾病。

饮食习惯不良如长期饮水量不足、膳食纤维摄入不足可能导致大便干燥，从而引发上述不适症状；药物副作用如阿片类药物可导致肠道蠕动减弱，而精神心理因素如抑郁焦虑则会引起自主神经功能紊乱，影响到胃肠道的正常运动，出现上述不适症状。此外，器质性病变如巨球蛋白血症、溃疡性结肠炎等其他疾病如糖尿病也可能会诱发上述不适症状。当患者出现上述不适症状时，应及时完善相关检查明确病因后配合医生积极治疗。

如果患者存在痔疮或肛裂等问题，也可能引起排便困难、肛门疼痛等症状。这些情况可能需要不同的治疗方法，因此在诊断时需考虑全面。

日常生活中，应保持充足的水分摄入，以软化大便，并增加膳食中的纤维含量，有助于改善便秘状况。同时，避免长时间憋便，及时处理心理压力，有利于维护肛门健康。