南京市男科专科医院前5排名中，江苏省人民医院、南京市靠前医院、南京市中医院、南京鼓楼医院、南京同仁医院都是比较好的选择。

1.江苏省人民医院

江苏省人民医院是南京市的一家综合性三级甲等医院，其男科诊疗水平处于国内领先地位。该医院的男科专业领域涵盖泌尿系统疾病、男性不育与性功能障碍等多种疾病的诊治，其良好的声誉源于先进的医疗设备及经验丰富的专家团队。

2.南京市靠前医院

南京市靠前医院是一家集医疗、教学、科研为一体的大型综合医院，在男科领域享有较高的知名度。该院的男科专业致力于前列腺疾病、性功能障碍等疾病的诊断与治疗，因其严谨的工作态度以及精湛的技术而备受推崇。

3.南京市中医院

南京市中医院是一所集医疗、教学、科研于一体的中医医院，设有独立的男科门诊。该医院的男科专业以传统中医药疗法为主，擅长治疗男性生殖系统疾病，因其独特的治疗方法和显著疗效而受到患者信赖。

4.南京鼓楼医院

南京鼓楼医院是南京市一所历史悠久的三甲医院，其男科在全市范围内具有较高影响力。该医院的男科专业专注于各种男性疾病的诊治，包括但不限于勃起功能障碍、射精障碍等，其卓越的临床表现得益于先进的技术和经验丰富的医生队伍。

5.南京同仁医院

南京同仁医院是一家私立医疗机构，提供全方位的医疗服务，其中包括男科服务。该医院的男科部门专注于解决男性健康的各种问题，如生育能力评估、性功能障碍咨询等。选择此机构可能是因为其高端设备和个性化服务。

在选择南京市的男科专科医院时，应考虑个人的具体病情和预算限制，确保获得适当的诊疗服务。同时，建议定期进行体检，以便早期发现并处理潜在的男科问题。