儿童不明原因肝炎的治疗可以考虑利巴韦林、阿昔洛韦、更昔洛韦、干扰素、拉米夫定等药物治疗。由于儿童不明原因肝炎的病因复杂，建议在专业医生指导下进行治疗。
1.利巴韦林
利巴韦林通过抑制病毒复制来发挥作用，可以减轻肝炎症状。 用于治疗由特定类型肝炎病毒感染引起的肝炎。在使用时需监测可能出现的副作用。
2.阿昔洛韦
阿昔洛韦能够有效抑制DNA合成，对特异性的DNA病毒有较好的抗病毒效果。 主要用于单纯疱疹病毒感染所致疾病及由水痘-带状疱疹病毒所引起的各种皮肤黏膜感染性疾病。
3.更昔洛韦
更昔洛韦是一种核苷酸类抗病毒药，能被病毒内的胸腺嘧啶核苷激酶选择性地磷酸化为单磷酸盐、二磷酸盐等，从而抑制病毒DNA合成。 本品主要用于免疫功能缺陷患者的巨球蛋白血症以及骨髓移植后的预防治疗。
4.干扰素
干扰素具有广谱抗病毒、抗增殖和免疫调节活性，在体外可抑制HBV复制。 干扰素适用于慢性乙型肝炎的治疗，尤其适合于HBeAg阳性者。
5.拉米夫定
拉米夫定是核苷类似物，能竞争性抑制HBVDNA多聚酶，从而抑制HBV的复制。 本品可用于伴有丙氨酸氨基转移酶升高和病毒活动复制的、肝功能代偿的成年慢性乙型肝炎病人的治疗。
儿童不明原因肝炎需要密切监测病情变化，及时发现并处理可能的并发症。除上述针对特定病因和症状的治疗外，肝脏保护和营养支持也是必不可少的组成部分，包括使用护肝药物如水飞蓟宾胶囊，以减轻肝脏炎症和损伤。
