经常腹泻导致肛门疼痛可能是由慢性结肠炎、肛裂、痔疮、直肠脱垂、肠道菌群失调等引起的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，明确诊断。

1.慢性结肠炎

慢性结肠炎是由多种原因引起的结肠炎症反应，如感染性、缺血性等，会导致结肠黏膜长期存在炎症和溃疡，进而引起腹泻。

当病变部位接近肛门时，炎症刺激可导致肛门周围组织出现红肿、疼痛等症状。患者可以在医生指导下使用柳氮磺吡啶片、美沙拉嗪肠溶片等药物进行治疗。

2.肛裂

肛裂是齿状线以下肛管皮肤层的小溃疡，其典型临床表现为排便时剧烈疼痛、出血和典型的周期性疼痛。由于局部伤口未愈合，每次排便时都会摩擦伤口，加剧疼痛和出血。患者可以遵医嘱使用复方角菜酸酯栓、马应龙麝香痔疮膏等药物缓解不适症状。

3.痔疮

痔疮是肛管静脉丛扩张、迂曲而形成的团块，若发生于肛门外侧，则可能因为粪便摩擦而导致疼痛。此外，痔核还会压迫周围神经，引起坠胀感。患者需要到医院通过手术的方式切除痔核，从而达到治愈的目的，例如外剥内扎术、吻合器痔上黏膜环切钉合术等。

4.直肠脱垂

直肠脱垂是指直肠壁的一部分或全层下移至肛门外的一种病理状态，当伴有炎症水肿时，就会有肛门疼痛的情况发生。同时，还可能会伴随有肛门瘙痒、排便困难等症状。对于轻度的直肠脱垂，可以通过提肛运动来改善症状；重度则需及时就医，在医生建议下采取经腹手术、经会阴手术等方式进行治疗。

5.肠道菌群失调

正常情况下，肠道内有益菌与有害菌处于平衡状态，能抑制病原体过度生长并帮助食物消化吸收。肠道菌群失调时，某些致病菌过度繁殖产生毒素，刺激肠黏膜，可能导致腹泻和肛门疼痛。患者可在医生指导下服用双歧杆菌三联活菌胶囊、枯草杆菌二联活菌颗粒等益生菌制剂来调整肠道微生态平衡。

针对频繁腹泻导致肛门疼痛的情况，建议患者定期进行大便常规、血常规以及结肠镜检查以评估病情进展。日常生活中注意保持肛周清洁干燥，避免食用辛辣刺激性食物，如辣椒、芥末等，以免加重肛门不适。