毛囊炎头上起个大疙瘩很疼可能是细菌感染、真菌感染、脂溢性角化病、寻常疣、瘢痕疙瘩等疾病引起的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，明确诊断。

1.细菌感染

细菌侵入毛囊导致炎症反应，引起局部红肿、疼痛和脓包形成。

可遵医嘱使用抗生素药膏如克林霉素磷酸酯凝胶、夫西地酸乳膏等进行局部抗感染治疗。

2.真菌感染

真菌通过皮肤表面微小创伤进入并繁殖，产生孢子和菌丝体，刺激毛囊发炎。这可能导致头皮出现瘙痒、红斑和疙瘩等症状。患者可在医生指导下口服伊曲康唑胶囊、盐酸特比萘芬片等抗真菌药物进行治疗。

3.脂溢性角化病

遗传因素和紫外线暴露可能增加患脂溢性角化病的风险，导致表皮细胞过度增生而形成良性肿瘤样病变。典型表现为扁平或略微隆起的斑块，有时伴有油腻鳞屑。对于较小且不影响功能的脂溢性角化病，可通过冷冻疗法或激光去除。

4.寻常疣

人乳头瘤病毒感染引起的皮肤上皮细胞异常增生，当病毒侵犯头部时，可能会诱发寻常疣的发生，通常为圆形或不规则形的坚实结节，一般无自觉症状，偶尔会有压痛感。寻常疣可通过刮除术、切除术等方式进行处理。

5.瘢痕疙瘩

由于个体差异，某些人在受到外伤后容易形成过度生长的瘢痕组织，这种组织在头皮上的累积可能导致硬结样凸起。针对瘢痕疙瘩的治疗方法包括糖皮质激素注射、硅胶贴片应用以及手术切除等。

建议定期观察头部疙瘩的变化，必要时可以进行皮肤镜检查以评估病情。日常生活中注意保持良好的个人卫生习惯，避免共用毛巾等个人用品，以免交叉感染。