怀孕合并卵巢囊肿时，应首先明确囊肿的性质再决定是否继续妊娠。
囊肿的性质是关键因素，因为不同类型的囊肿对妊娠的影响存在差异。良性囊肿如黄体囊肿通常会随着孕期结束而自行消退，不影响妊娠；而对于恶性囊肿如上皮性囊腺癌则可能会影响母婴健康，需及时处理。因此，在确定囊肿性质后才能做出更合理的决策。
若囊肿出现破裂、扭转或蒂部扭转，则可能导致急性腹痛、内出血等紧急状况，此时不建议继续妊娠，以免加重病情风险。
孕期女性应注意定期产检监测囊肿变化，避免剧烈运动以减少囊肿扭转的风险。同时，保持良好的营养状态和充足的休息也是必要的。