吃了番茄红素小便刺痛，可能是番茄红素导致，也可能是泌尿系统感染、泌尿系统结石、过敏等因素导致，建议患者及时到医院就诊，在医生指导下进行相应的治疗。

1、番茄红素：是从深红色的番茄中提取的一种天然色素，能够保护男性的精子质量，具有抗氧化的作用，可通过尿液排出体外，如果吃了番茄红素后小便刺痛，可能是色素随着尿液排出刺激尿道导致，这属于正常的生理现象，不需要进行治疗;

2、泌尿系统感染：如膀胱炎等，如果患者本身患有膀胱炎，由于番茄红素具有一定的消炎杀菌作用，可以帮助控制病情，但这种物质无法消除感染源，若原本就存在感染未控制的情况，就会导致吃了番茄红素小便刺痛。患者可以在医生指导下通过服用抗生素药物进行治疗，如阿莫西林胶囊、左氧氟沙星片等;

3、泌尿系统结石：如输尿管结石等，由于结石对输尿管黏膜造成刺激，患者可出现小便刺痛的症状，如果此时吃了番茄红素，可能会误以为是吃了番茄红素导致。患者可以在医生指导下口服排石颗粒等药物促进结石排出，必要时也可以通过体外冲击波碎石术等手术进行治疗;

4、过敏：如对番茄过敏的患者，吃了番茄红素后可能会出现过敏症状，如皮肤红疹、瘙痒等，由于皮肤受到了过敏原的刺激，就可能会出现小便刺痛的症状。建议患者在医生的指导下口服氯雷他定片、盐酸西替利嗪片等抗过敏药物进行治疗。