由于肛瘘和腋臭都属于常见的外科疾病，需要通过手术的方式才能达到治愈的目的，所以两者可以一起做手术。但是需要注意的是，在进行手术之前，应该先明确诊断，以确保手术的安全性和有效性。另外，对于存在严重全身性疾病、局部麻醉效果不佳者不建议使用该方式进行处理。
如果患者有严重的全身性疾病，比如高血压、糖尿病等，则不建议同时进行肛瘘和腋臭手术，以免加重病情或影响术后恢复。
在考虑同时进行肛瘘和腋臭手术时，应评估两种疾病的严重程度以及患者的全身状况，并遵循医生的指导进行治疗。此外，还应注意术后的护理工作，保持切口干燥清洁，避免感染的发生。
