肾肉芽肿性肾盂肾炎的治疗可以考虑抗生素治疗、免疫调节治疗、中药治疗、经皮肾镜取石术、肾切除术等方法。

1.抗生素治疗

抗生素治疗通过使用特定的抗生素来抑制或杀死细菌，以控制感染。对于由细菌引起的肾盂肾炎，应在尿液培养结果出来前开始经验性抗生素治疗，并根据药敏试验调整方案。

2.免疫调节治疗

免疫调节治疗旨在平衡机体的免疫反应，减少异常免疫激活对肾脏的损伤。

在肾肉芽肿性肾盂肾炎中，可选用环磷酰胺、他克莫司等免疫抑制剂控制病情进展。

3.中药治疗

中药治疗利用具有清热解毒、利水消肿功效的草药改善症状。对于存在湿热下注证候者，可考虑使用八正散加减；但需注意个体差异及可能的副作用。

4.经皮肾镜取石术

经皮肾镜取石术是一种微创手术，在局部麻醉或全身麻醉下将肾内的结石取出。主要针对较大的肾内钙化块导致的梗阻性病变。术后应预防感染，如应用头孢曲松钠注射液。

5.肾切除术

肾切除术是移除整个受影响肾脏的手术，通常作为最后手段。当保守治疗无效且患者无功能保留时，可考虑行患侧肾切除术。

肾肉芽肿性肾盂肾炎的治疗需综合考虑多种因素，定期复查必不可少，监测病情变化。此外，患者还应注意个人卫生，保持良好的生活习惯，以利于疾病的恢复和管理。