轻度的藏毛囊肿感染可通过抗生素治疗得到控制，此时并不一定需要手术；但如果感染加重或者伴有严重的全身症状，则可能需要及时手术治疗以防止感染进一步扩散。此外，对于复发性囊肿或多房性囊肿，也建议考虑手术切除以防再次感染。在决定是否需要手术时，应综合考虑患者的全身状况以及囊肿的具体情况。
如果患者有糖尿病、免疫功能低下或存在局部血液循环障碍等情况，可能导致感染不易控制，此时可能需要更积极地处理，包括手术。
在诊断为藏毛囊肿感染后，应注意保持皮肤清洁干燥，避免过度摩擦和挤压病变部位，以免引起继发感染。若出现发热、寒战等全身症状，应及时就医评估是否需行手术治疗。
