先天性肠旋转不良的病因可能与遗传因素、感染、消化系统发育不全、营养缺乏、食物过敏等有关，具体用药需根据医生评估后决定。建议患者及时就医以获得专业治疗。

1.遗传因素

先天性肠旋转不良可能与家族遗传有关，因为某些基因突变可能导致肠道发育异常。由于无法通过药物直接改善基因异常，因此不能用药物进行治疗。

2.感染

如果孕妇在怀孕期间存在感染性疾病，如巨球蛋白血症、风疹等，这些病原体可通过胎盘传播给胎儿，导致胎儿发生肠管粘连和狭窄。感染会导致局部组织水肿和炎症反应，进而影响肠壁血液循环，久而久之就会形成肠梗阻。患者可在医生指导下使用抗生素类药物进行抗感染治疗，比如阿莫西林胶囊、头孢克肟颗粒等。

3.消化系统发育不全

消化系统发育不全是由于胚胎时期中肠扭转不全所致，这种情况会影响小肠的正常位置排列，进而引起肠腔狭窄或者闭塞，从而出现呕吐、腹胀、停止排胎便等症状。针对此病因，可遵照医师的意见给予患儿服用枯草杆菌二联活菌颗粒、双歧杆菌三联活菌散等益生菌制剂来调理肠胃功能。

4.营养缺乏

营养缺乏是指身体所需的重要营养素摄入不足，可能会干扰肠管的正常生长发育过程，导致先天性肠旋转不良的发生。补充必要的营养素是关键所在，可以通过调整饮食结构或口服维生素B族片、复合维生素B片等方式来满足机体的需求。

5.食物过敏

食物过敏可能由遗传易感性和环境触发因素共同作用引起，当机体对特定食物产生过敏反应时，会引起免疫系统的过度反应，导致黏膜肿胀和通透性增加，继而导致腹泻、皮疹等症状。治疗食物过敏通常需要避免接触已知过敏的食物，对于轻度过敏者，可以尝试脱敏疗法；严重过敏则需携带急救药物如肾上腺素自动注射器以备不时之需。

建议定期进行新生儿体检以及婴儿生长监测，以便早期发现并处理相关问题。必要时，应考虑进行超声波检查、X线平片或CT扫描以评估肠管位置和结构是否正常。