针对新生儿黄疸的治疗中，蓝光照射后出现大便发黑可能是由胆红素脑病引起的。

因为新生儿黄疸主要是由于未结合胆红素在体内的积累所致，当未结合胆红素通过特殊的转运蛋白进入大脑时，会与神经细胞内的质子交换，使胆红素转变为胆红素酯。这种胆红素酯不溶于水且难以被清除，因此会导致胆红素脑病的发生。该疾病会引起中枢神经系统受损，导致核黄疸，进而引发大便发黑的症状。

此外，如果新生儿除了黄疸外还伴有发热、腹泻等症状，则需要考虑感染性肠炎的可能性。此时，医生可能会建议进行血常规检查以评估感染程度，并可能给予抗生素治疗。

新生儿黄疸需密切监测，避免过度日晒，以免加重皮肤黄染；同时应确保充足睡眠，促进肝脏功能发育，有助于胆红素的代谢和排泄。