点扁平疣留下黑印一般可以自行消退。

点扁平疣主要是由人类乳头瘤病毒感染所引起的一种病毒性皮肤病，具有一定的自限性。

在治疗过程中，由于炎症反应和组织损伤，可能导致局部黑色素细胞活性增强，产生暂时性的色素沉着，形成黑印。随着机体免疫系统的清除作用，这些异常增生的细胞会被消除，从而达到自然痊愈的效果。

若患者皮肤屏障受损或存在日晒导致的色素沉着，则可能需要更长时间才能恢复。

患者应避免搔抓扁平疣，以免加重炎症反应和促进色素沉着。日常要做好防晒措施，外出时涂抹防晒霜或者打遮阳伞等。