孕妇大便通畅肛门疼痛可能是便秘、痔疮等原因引起的。

便秘时粪便在肠道内停留时间过长，水分被过度吸收后会变得干燥坚硬，从而加重排便时的摩擦和刺激肛门黏膜，引起疼痛。痔疮是由于长期便秘、腹压增加等因素导致肛垫下移和静脉曲张所形成的，当排便时，干硬的粪便会对已经肿胀的痔核产生挤压和摩擦，从而诱发疼痛。

如果孕妇出现大便通畅但伴有肛门疼痛的症状，还应注意是否存在肛裂或直肠脱垂等疾病。这些疾病也可能导致肛门区域不适，需进一步排查。

孕期肛门疼痛应避免使用可能影响胎儿健康的药物治疗，可通过饮食调整和适量运动缓解症状，如高纤维食物摄入和适度步行。若疼痛持续不缓解或者伴有其他不适，应及时就医咨询。